Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms