Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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VPS72Q15906 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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VPS72Q15906 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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VPS72Q15906 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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VPS72Q15906 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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VPS72Q15906 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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VPS72Q15906 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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VPS72Q15906 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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