Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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PDCD1Q15116 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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PDCD1Q15116 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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PDCD1Q15116 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PDCD1Q15116 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PDCD1Q15116 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PDCD1Q15116 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PDCD1Q15116 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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PDCD1Q15116 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PDCD1Q15116 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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