Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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