Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms