Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms