Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
DUSP4Q13115 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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