Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAX2Q9UIW0 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms