Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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