Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms