Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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