Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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