Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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HOXD10P28358 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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HOXD10P28358 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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HOXD10P28358 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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HOXD10P28358 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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