Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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