Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms