Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms