Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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