Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FSCN1Q16658 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms