Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms