Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms