Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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