Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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