Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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