Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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