Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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