Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HMGN3Q15651 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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