Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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