Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms