Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms