Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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RUNX3Q13761 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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RUNX3Q13761 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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RUNX3Q13761 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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RUNX3Q13761 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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RUNX3Q13761 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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RUNX3Q13761 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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