Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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