Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms