Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NME3Q13232 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NME3Q13232 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
NME3Q13232 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NME3Q13232 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms