Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMPOP42166 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TMPOP42166 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms