Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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SH3BP4Q9P0V3 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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SH3BP4Q9P0V3 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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SH3BP4Q9P0V3 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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