Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms