Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC098583.2-201ENST00000504151 372 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC079340.2-202ENST00000504785 448 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC087241.3-201ENST00000542076 862 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL157955.2-202ENST00000553921 467 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC007495.1-202ENST00000565155 559 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 NAPA-AS1-202ENST00000594367 630 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.46-201ENST00000611137 251 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL4P3-201ENST00000428881 1311 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PLAG1-202ENST00000423799 1684 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 GACAT1-201ENST00000419650 577 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 IGLVIVOR22-2-201ENST00000430579 330 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC093166.1-201ENST00000442243 330 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms