Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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