Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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CTF1Q16619 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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CTF1Q16619 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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CTF1Q16619 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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CTF1Q16619 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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CTF1Q16619 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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CTF1Q16619 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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CTF1Q16619 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTF1Q16619 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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