Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PICALMQ13492 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PICALMQ13492 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms