Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHAF1AQ13111 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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