Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms