Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC5P78333 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC5P78333 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC5P78333 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC5P78333 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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GPC5P78333 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC5P78333 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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GPC5P78333 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC5P78333 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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