Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LTBRP36941 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LTBRP36941 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LTBRP36941 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LTBRP36941 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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