Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRDP23468 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRDP23468 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRDP23468 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PTPRDP23468 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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PTPRDP23468 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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PTPRDP23468 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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