Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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UBXN4Q92575 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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UBXN4Q92575 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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UBXN4Q92575 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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UBXN4Q92575 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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