Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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RTL8BQ17RB0 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RTL8BQ17RB0 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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