Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
USF2Q15853 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
USF2Q15853 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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