Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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