Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms